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• 谢健：党组书记、厅长
• 代永林：党组成员、驻省审计厅纪检监察组组长
• 付云昆：党组成员、副厅长
• 张勇：党组成员、副厅长
• 孙正星：党组成员、副厅长
• 王辉：副厅长
• 李涛：总审计师
• 陈琦：云南省领导干部任期经济责任审计工作联席会议办公室主任

• 办公室
• 审理处
• 计划财务处
• 法规督查处
• 财政审计处
• 金融审计处
• 行政事业审计处
• 企业审计处
• 自然资源和生态环境审计处
• 农业农村审计处
• 社会保障审计处
• 固定资产投资审计二处
• 固定资产投资审计一处
• 电子数据审计处
• 机关党委（人事处）
• 经济责任审计一处
• 经济责任审计二处
• 经济责任审计三处
• 涉外审计处
• 内部审计指导中心
• 计算机技术中心
• 科研培训中心
• 机关服务中心
• 云南省审计厅派出机构